Przedsiębiorcy, zwani małymi podatnikami, mają sposobność dokonania wyboru metody kasowej rozliczeń. Metoda ta polega na tym, że obowiązek podatkowy powstaje z dniem uregulowania całości lub części należności, nie później jednak niż 90 dnia od dnia wydania towaru lub wykonania usługi. Częściowe uregulowanie należności przez kontrahenta także spowoduje powstanie obowiązku podatkowego, jednak wyłącznie w odniesieniu do zapłaconej części należności.

Fakturę VAT-MP wystawia się nie później niż siódmego dnia od wydania produktu lub wykonania usługi. Natomiast w przypadku, gdy MP uzyskał zaliczkę na poczet tego rachunku, nie później niż do siódmego dnia od uzyskania tej zaliczki.

Ogromnie ważne jest, by wszystkie faktury małego podatnika oznacza, jako „MP”, a w chwili otrzymywania kolejnych części zapłat wystawić na nie następne faktury VAT-MP. Dokumenty powinny zawierać te same elementy co faktury zaliczkowe. Mały podatnik wystawiając fakturę, musi opisać ją, jako 'Faktura VAT-MP' oraz zaznaczyć informację o terminie płatności. W przypadku, gdy faktura VAT nie będzie posiadała tego zapisu zostanie potraktowana jako błędnie wystawiona.

Dla płatników używających metody kasowej ustawodawca przewidział dodatkowe części składowe, jakie powinna obejmować wystawiana przez nich faktura. Poza głównymi elementami dokumenty wystawiane przez małych podatników muszą obejmować:

- oznaczenie 'FAKTURA VAT - MP'

- okres płatności należności określonej w fakturze

W przypadku kupna produktów i usług od małego podatnika, udokumentowanych fakturą oznaczoną zgodnie z przepisami 'FAKTURA VAT-MP', płatnik może obniżyć kwotę podatku należnego o kwotę podatku naliczonego określoną w tej fakturze, w rozliczeniu za miesiąc, w jakim:

- w sytuacjach pozostałych niż zapisane powyżej,
- przypada 90 dzień od dnia nabycia towaru lub wykonania usługi,
- uregulował część należności na rzecz MP,
- uregulował całość należności na rzecz MP

Możliwość korzystania z metody kasowej jest związana z koniecznością wcześniejszego, pisemnego zawiadomienia naczelnika urzędu skarbowego o wyborze tej formy. Zawiadomienie złożyć trzeba w okresie do końca miesiąca poprzedzającego okres, za jaki podatnik będzie stosował metodę kasową. Konsekwencją wyboru tej metody rozliczeń podatku VAT jest także kasowy, zależny od zapłaty, sposób zmniejszania kwoty podatku należnego o VAT naliczony.

Zmniejszenia podatku należnego, mały podatnik może dokonać w rozliczeniu za za 3 miesiące, w których:

- uregulował należność powstała z uzyskanej od kontrahenta faktury

- zapłacili podatek wypływający z dokumentu celnego,uwzględnieniem kwot wynikających z decyzji naczelnika urzędu celnego, nie wcześniej jednak niż z dniem uzyskania faktury lub dokumentu celnego.